課程資訊
課程名稱
植物基因體學
Plant Genomics 
開課學期
106-1 
授課對象
生物資源暨農學院  作物科學組  
授課教師
林彥蓉 
課號
Agron5056 
課程識別碼
621 U6450 
班次
 
學分
3.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五6,7,8(13:20~16:20) 
上課地點
 
備註
農藝館316與劉力瑜、董致韡、黃永芬合授
總人數上限:16人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1061Agron5056_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
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課程概述

Genome science has been one of the most blooming sciences in the past decade. The complete genome sequences of the dicot model plant, Arabidopsis, and of the monocot crops such as rice, sorghum and maize are released. In addition, many crops and plants are undergone sequencing. The genomic information provides various research methodologies and speeds up traditional researches. This course will emphasize on genetic mapping, physical mapping, and genome sequencing and annotating to dissect plant genomes. Consequently, this course will introduce the applications of genomics in positional cloning, gene expression, comparative mapping, and genetic variation, and so on.  

課程目標
Organization and Structure of Genomes
Assemblies of Genetic and Physical Maps
Genome Sequencing Projects
Plant Functional Genomics
Bioinformatics-Sequence alignment, comparative genomics
SNPs and Variation
 
課程要求
待補 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 備註: 與授課老師聯繫 
指定閱讀
待補 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/15  Introduction of Plant Genomics (Lin) 
第2週
9/22  Organization and Structure of Genomes (Lin) 
第3週
9/29  Establishing a Linkage Map and Physical Map of Genome (Huang) 
第4週
10/06  Sequence Alignment (Liu)  
第5週
10/13  Bioinformatics: Lab of Sequence Alignment (Liu)  
第6週
10/20  Genome Sequencing Methods and Strategies (Tung) 
第7週
10/27  Application of Next Generation Sequencing (Tung) 
第8週
11/03  Global Gene Expression (Liu)  
第9週
11/10  Bioinformatics: Lab of Global Gene Expression (Liu)  
第10週
11/17  Midterm 
第11週
11/24  Genome Variation (Tung) 
第12週
12/01  Comparative Genomics (Huang) 
第13週
12/08  Transposable Elements (Huang) 
第14週
12/15  Genesis of New Genes (Huang) 
第15週
12/22  Current Plant Genome Projects in Taiwan (Lin) 
第16週
12/29  Plant Genome Projects (Huang) 
第17週
1/05  Presentation Lin, Liu, Tung, Huang